Visualización
Visualizador molecular gratuito y lleno de funciones
Visualice la ciencia
La visualización molecular es un aspecto clave del análisis y la comunicación de los estudios de modelado. Permite visualizar una comprensión mecanicista de la estructura de una molécula, de modo que se pueden compartir los principales conocimientos entre los expertos en modelado computacional y los miembros del equipo de colaboración.
BIOVIA Discovery Studio Visualizer es una aplicación gratuita de modelado molecular con numerosas funciones para visualizar, compartir y analizar datos de proteínas y moléculas pequeñas. Los expertos y sus compañeros pueden intercambiar resultados de forma fluida y eficaz, sin perder tiempo ni información científica.
Discovery Studio Visualizer está diseñado para captar los matices específicos de su investigación:
- Gráficos de alta calidad con opciones de pantalla avanzadas y compatibilidad estéreo
- Capacidad para generar imágenes con calidad de publicación
- Vista gráfica interactiva en 3D con vistas de tabla de datos y jerarquía asociadas
- Superficies de varios lados e isosuperficies para una mejor visualización molecular
- Capacidad para trazar datos de varias series de datos con gráficos de líneas y puntos, gráficos 3D y gráficos de barras
- Funcionalidad de creación de gráficos, incluidos mapas de calor, histogramas, gráficos de tasa de aciertos, etc.
- Funcionalidad de guion gráfico para capturar series de vistas moleculares para enseñar y compartir
- Exportación de guiones gráficos como películas
- Funcionalidad de ordenación, filtrado y agrupación disponible para las propiedades en la tabla de datos
- Secuencias de comandos en Perl para automatizar tareas repetitivas o vincular tareas para facilitar el uso
- Paneles de herramientas, barras de herramientas y diseño de la interfaz personalizables según se desee
- Compatibilidad con una amplia variedad de formatos de archivo de estructura y secuencia
- Cálculos RMS disponibles en diferentes niveles de detalle
- Monitores disponibles para una amplia variedad de interacciones no enlazadas favorables, desfavorables e insatisfactorias
- Creadores moleculares de péptidos y ácidos nucleicos
- Cálculo de la accesibilidad a disolventes para identificar residuos enterrados y expuestos
- Funcionalidad de gráficos, incluidos gráficos de contacto y Ramachandran
- Carga de estructuras de proteínas directamente desde la base de datos de PDB
- Generación de informes de proteínas para resumir los datos en estructuras de proteínas
- Construcción de la unidad biológicamente activa de una proteína a partir de sus subunidades
- Funcionalidad de proteínas limpias para agregar las cadenas laterales que faltan, eliminar trastornos y estandarizar la nomenclatura atómica
- Visualización mejorada de secuencias de proteínas y ácidos nucleicos, y análisis de su composición y alineaciones
- Superposición de estructuras basadas en anclajes, residuos y alineación de secuencias
- Predicción de la estructura secundaria de secuencias de proteínas
- Ventana de anotaciones para ver y editar anotaciones de las secuencias de ácidos nucleicos y proteínas
- Visualización y contorno de mapas de densidad de electrones de rayos X
- Herramientas básicas para editar estructuras de rayos X
- Muestreo de conformaciones de rotámeros de cadenas laterales y análisis de interacciones
- Superficies de interacción receptor-ligando que muestran hidrofobicidad, enlaces de hidrógeno, aromaticidad, etc.
- Visualización de la representación en 2D de las moléculas en la tabla de datos
- Herramientas de croquis para crear nuevas moléculas pequeñas
- Modificación o creación de moléculas pequeñas 3D personalizadas mediante un panel de herramientas de fragmentos predefinidos
- Optimización de la geometría de las estructuras construidas con un campo de fuerza rápido de tipo Dreiding
- Posibilidad de calcular propiedades moleculares básicas, como la fórmula molecular y el peso molecular
- Superposición de estructuras basada en la superposición molecular mediante la alineación de campos o los anclajes
- Definición, visualización y edición de sitios de unión de ligandos
- Generación de trazados 2D de interacción receptor-ligando
- Análisis de los patrones de unión de ligandos entre una proteína y sus ligandos asociados
- Generación manual de consultas de farmacofóforos (Catalyst)
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