Diseño y optimización bioterapéuticos
Combine la potencia de la IA con flujos de trabajo basados en la física para desarrollar productos biológicos de nueva generación
Mejore la creación de productos biológicos con IA y modelado molecular
La precisión y la velocidad son fundamentales en el cambiante panorama actual de las terapias biológicas. Los métodos basados en IA transforman la forma en la que los investigadores abordan tareas complejas y aceleran el descubrimiento para encontrar nuevas terapias. Gracias a la integración de modelos de IA vanguardistas, como AlphaFold2/OpenFold, RFDiffusion y ProteinMPNN, Discovery Studio Simulation en la plataforma 3DEXPERIENCE® permite a los modeladores moleculares y biólogos computacionales pasar de la ideación a candidatos potenciales optimizados con mayor eficiencia, puesto que pueden identificar los mejores candidatos bioterapéuticos más rápido a un coste reducido.
Como aplicación de software como servicio (SaaS), Discovery Studio Simulation permite acceder fácilmente a la potencia de estos métodos sin necesidad de implementar hardware costoso ni de contar con experiencia técnica. La interfaz fácil de usar permite a los usuarios combinar el aprendizaje profundo con el modelado basado en la física en un flujo de trabajo unificado para realizar fácilmente complejas tareas computacionales que requieren informática de alto rendimiento.
Diseño biológico generativo en 3DEXPERIENCE
Discovery Studio Simulation ofrece ahora acceso a RFDiffusion para diseñar nuevos andamios de proteínas que incorporen un motivo conocido, así como a la familia de modelos ProteinMPNN para generar nuevas bibliotecas de secuencias de proteínas para una estructura determinada. Junto con AlphaFold2/OpenFold, estos modelos amplían el creciente conjunto de soluciones basadas en IA de BIOVIA en la plataforma 3DEXPERIENCE, para ayudar a los biólogos computacionales a explorar un espacio biológico más amplio para el descubrimiento de nuevas bioterapias.
Predicción de estructuras con inteligencia artificial
Discovery Studio Simulation ofrece OpenFold para predecir estructuras de monómero y AlphaFold2 para predecir estructuras de multímero en la plataforma 3DEXPERIENCE. Al combinar estos modelos con enfoques basados en la física en una sola aplicación, Discovery Studio Simulation permite a los científicos perfeccionar sus estructuras generadas por IA con simulaciones de dinámica molecular y seguir los flujos de trabajo posteriores para optimizar sus candidatos principales, como el cribado virtual mediante acoplamiento, el muestreo de estados conformacionales con una dinámica molecular de muestreo mejorada o el estudio de las propiedades de la formulación de proteínas.
Flujos de trabajo completos basados en la física para el descubrimiento de productos bioterapéuticos
Discovery Studio Simulation es una solución de modelado molecular todo en uno que ofrece flexibilidad y versatilidad para diseñar y optimizar productos bioterapéuticos de alta calidad. Al respaldar a los investigadores desde la predicción de estructuras hasta el mapeo de epítopos, la maduración por afinidad, la humanización, la predicción de solubilidad y la formulación de excipientes, proporciona flujos de trabajo in silico completos con los mejores métodos computacionales de su clase. Discovery Studio Simulation permite a los investigadores centrarse en los candidatos con más probabilidades de tener éxito en la clínica, acelerar los plazos, reducir los costes y agilizar el proceso tradicionalmente laborioso de descubrir nuevas bioterapias.
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Preguntas frecuentes sobre soluciones para productos bioterapeúticos
Los productos bioterapéuticos, también conocidos como terapias biológicas o productos biológicos, proceden de organismos vivos. Incluyen anticuerpos monoclonales, terapias basadas en anticuerpos (por ejemplo, conjugados de fármacos con anticuerpos, bispecíficos), vacunas, terapias celulares y génicas, y más. Los productos bioterapéuticos suelen ser más grandes y complejos que los fármacos tradicionales de moléculas pequeñas. Debido a su mayor especificidad y capacidad para dirigirse a rutas complejas, los productos bioterapéuticos se utilizan para tratar enfermedades mucho más complejas, como el cáncer, los trastornos autoinmunes o las condiciones neurológicas.
Discovery Studio Simulation es una aplicación SaaS disponible en la plataforma 3DEXPERIENCE que permite a los usuarios combinar el aprendizaje profundo con el modelado basado en la física para el descubrimiento de fármacos en una interfaz fácil de usar. Proporciona métodos para predecir la estructura de las proteínas, realizar simulaciones de dinámica molecular (MD), mapear epítopos, humanización y mucho más. Esta plataforma integral respalda el trabajo de los investigadores durante todo el proceso de descubrimiento y optimización de productos bioterapéuticos, lo que reduce los costes y acelera los plazos.
Además de MODELER, el algoritmo de modelado por homología líder en el mercado establecido desde hace mucho tiempo, Discovery Studio Simulation ofrece el modelo de IA AlphaFold2, ganador de un premio Nobel, para predecir estructuras de multímeros. Dassault Systèmes también es miembro de OpenFold Consortium y ofrece OpenFold para ayudar a predecir las estructuras de monómeros. Los usuarios pueden combinar estos modelos con simulaciones de MD para perfeccionar sus estructuras generadas por IA o respaldar los flujos de trabajo posteriores, como el acoplamiento, el muestreo conformacional y los estudios de formulación de proteínas para optimizar los principales candidatos.
Sí, como aplicación SaaS, Discovery Studio Simulation elimina la necesidad de implementar hardware costoso o de contar con una amplia experiencia técnica. Su interfaz basada en la nube proporciona un acceso fluido a informática de alto rendimiento, lo que permite a los investigadores realizar tareas complejas sin esfuerzo.
La plataforma admite una amplia gama de flujos de trabajo esenciales para la investigación y el desarrollo de procesos de bioterapia, entre los que se incluyen:
- Predicción de la estructura de las proteínas
- Mapeo de epítopos y maduración por afinidad
- Humanización de anticuerpos
- Predicción de solubilidad y formulación de excipientes
- Análisis de interacción proteína-proteína y acoplamiento.
Al integrar la IA y el modelado basado en la física, Discovery Studio Simulation optimiza el descubrimiento de productos bioterapéuticos. Ayuda a los investigadores a identificar a los mejores candidatos antes de pasar a las pruebas experimentales. Como resultado, los equipos pueden reducir el tiempo y los costes asociados al descubrimiento de productos bioterapéuticos.
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