可视化
免费的、功能丰富的分子可视化工具
让科学变得可视化
分子可视化是建模研究分析和交流中的一个关键方面。它支持从机械角度了解可视化的分子结构,因此计算建模专家和协作团队成员之间可以共享关键的深度见解。
BIOVIA Discovery Studio Visualizer 是一款免费的、功能丰富的分子建模应用,可用于查看、共享和分析蛋白质和小分子数据。专家及其同事可以无缝高效地交流成果,避免浪费时间或遗漏科学信息。
Discovery Studio Visualizer 旨在帮助您捕获研究中的具体细微差别:
- 具有先进显示选项和立体声支持的高质量图形
- 能够生成出版质量的图像
- 具有相关层级和数据表视图的交互式 3D 图形视图
- 可增强分子可视化的多面曲面和等值面
- 能够使用线图、点图、3D 图和条形图绘制多个数据系列的数据
- 图表功能包括热图、直方图、命中率图等
- Storyboard 功能能够捕获一系列分子视图,以进行演示和共享
- 将 Storyboard 导出为影片
- 对数据表中的属性提供排序、过滤和分组功能
- Perl 脚本可自动执行重复性任务,或将任务链接在一起,以便于使用
- 可根据需要自定义工具面板、工具栏和界面布局
- 支持各种结构和序列文件格式
- 能够以不同的细节水平进行 RMS 计算
- 可监控各种有利、不利和未满足的非键合相互作用
- 面向肽和核酸的分子构建器
- 计算溶剂可及性,以识别掩藏的和暴露的残基
- 绘图功能,包括拉氏构象图和接触图
- 直接从 PDB 数据库加载蛋白质结构
- 生成蛋白质报告,以总结蛋白质结构中的数据
- 从亚基构建蛋白质的生物活性单元
- 清洁蛋白质功能,可添加缺失的侧链、去除无序部分并将原子命名标准化
- 增强蛋白质和核酸序列的显示及其成分和排列的分析
- 根据连接链、残基和序列比对叠加结构
- 蛋白质序列的二级结构预测
- 注释窗口,用于查看和编辑核酸和蛋白质序列的注释
- 显示 X 射线电子密度图并绘制轮廓图
- 编辑 X 射线结构的基本工具
- 侧链旋转异构体构象采样及相互作用分析
- 受体-配体相互作用曲面表现出疏水性、氢键性、芳香性等
- 查看数据表中分子的 2D 描述
- 草图工具,可用于创建新的小分子
- 使用预定义片段的工具面板修改或构建自定义 3D 小分子
- 使用类似 Dreiding 的快速力场优化建成结构的几何结构
- 可以计算分子式和分子量等基本分子特性
- 利用场对齐或连接链,在分子叠加的基础上叠加结构
- 定义、显示和编辑配体结合位点
- 生成 2D 受体-配体相互作用图
- 分析蛋白质与其结合配体之间的配体结合模式
- 手动生成药效团(催化剂)查询
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