基于配体和药效团的设计
使用一流的工具增强小分子疗法设计
有多种空间排列和电化学因素会引起蛋白质和配体的结合相互作用。了解这些相互作用有助于研究人员更快速确定有希望的备选新疗法。药效团的这些特征映射到 3D 空间中，即可简单地虚拟筛选化合物库，描述现有先导化合物的结合并优化其性能。
BIOVIA Discovery Studio 利用 CATALYST 药效团建模和分析工具集，协助评估有/无靶标结构化数据的小分子疗法。它支持全新药物设计、多靶标药物设计和活性分析，以推动小分子研发。
- 构建
- 应用
- 设计
构建
- 根据可用数据自动生成药效团
- 活性配体组
- 受体结合位点
- 受体-配体复合物
- 根据多组具有已知活性的对照化合物，执行严格的药效团验证。
- 假设可包括
- 几何的、基于特征的查询
- 形状相似性
- “禁止”空间
- 通过探索适用于具有多种作用模式风险的超大型/多样化化合物集的聚合药效团，突破经典药效团解析算法的限制
应用
开展稳健的药效团筛选研究
- 构建和搜索 3D 构象数据库
- 考虑并分析配体的完整构象空间
- 使用 PharmaDB* 数据库探索脱靶活性和药物再利用
Discovery Studio 现在包括最广泛的配体分析报告数据库。PharmaDB 基于 scPDB* 进行构建和验证，包含了大约 240,000 个受体-配体药效团模型。
设计
设计和描述配体和组合库
- 枚举基于反应或基于核心的库
- 枚举电离状态、互变异构体和同分异构体
- 根据 Lipinski 和 Veber 规则或您自己的标准，过滤不合适的具有非期望官能团的备选药物
- 计算各种物理化学和指纹特性
- 使用帕累托优化、多样性和相似性分析来优化组合库
- 使用 PCA 分析的聚类工具和 3D 可视化
开启您的旅程
利用 BIOVIA Discovery Studio 加速药物发现。
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