Progettazione e ottimizzazione di bioterapie
Combina la potenza dell'intelligenza artificiale con flussi di lavoro basati sulla fisica per i prodotti biologici di prossima generazione
Fai progredire le scoperte biologiche con l'IA e la modellazione molecolare
Precisione e velocità sono fondamentali nell'attuale panorama in rapida evoluzione delle terapie biologiche. I metodi basati sull'intelligenza artificiale trasformano il modo in cui i ricercatori affrontano attività complesse e accelerano la scoperta di nuove terapie. Grazie all'integrazione di modelli IA all'avanguardia, tra cui AlphaFold2/OpenFold, RFDiffusion e la famiglia di modelli ProteinMPNN, Discovery Studio Simulation sulla piattaforma 3DEXPERIENCE® consente ai modellatori molecolari e ai biologi computazionali di passare dall'ideazione all'ottimizzazione dei principali candidati con maggiore efficienza, identificando più rapidamente e a costi ridotti i migliori candidati alle bioterapie.
In quanto applicazione Software-as-a-Service (SaaS), Discovery Studio Simulation consente di accedere facilmente alla potenza di questi metodi senza la necessità di costosi hardware o competenze tecniche. Grazie all'interfaccia intuitiva, gli utenti possono combinare il deep learning con la modellazione basata sulla fisica in un flusso di lavoro unificato, navigando senza sforzo in complesse attività di calcolo che richiedono High Performance Computing.
Progettazione generativa di prodotti biologici su 3DEXPERIENCE
Discovery Studio Simulation offre ora l'accesso a RFDiffusion per la progettazione di nuove impalcature proteiche che incorporano motivi noti e alla famiglia di modelli ProteinMPNN per la generazione di nuove librerie di sequenze proteiche per una determinata struttura. Insieme ad AlphaFold2/OpenFold, questi modelli ampliano la suite in continua crescita di potenti soluzioni IA di BIOVIA sulla piattaforma 3DEXPERIENCE, aiutando i biologi computazionali a esplorare uno spazio biologico più ampio per la scoperta di nuove bioterapie.
Previsione della struttura con l'intelligenza artificiale
Discovery Studio Simulation offre OpenFold per la previsione della struttura dei monomeri e AlphaFold2 per la previsione della struttura dei multimeri sulla piattaforma 3DEXPERIENCE. Combinando questi modelli con approcci basati sulla fisica in un'unica applicazione, Discovery Studio Simulation consente agli scienziati di perfezionare le strutture generate dall'intelligenza artificiale con simulazioni di dinamica molecolare e di seguire i flussi di lavoro a valle per l'ottimizzazione dei candidati principali, come lo screening virtuale tramite docking, il campionamento degli stati conformazionali con la dinamica molecolare a campionamento avanzato o lo studio delle proprietà di formulazione delle proteine.
Flussi di lavoro completi basati sulla fisica per la scoperta di bioterapie
Discovery Studio Simulation è una soluzione di modellazione molecolare all-in-one che offre flessibilità e versatilità per la progettazione e l'ottimizzazione di bioterapie di alta qualità. Supportando i ricercatori dalla previsione della struttura alla mappatura degli epitopi, alla maturazione dell'affinità, all'umanizzazione, alla previsione della solubilità e alla formulazione degli eccipienti, fornisce flussi di lavoro in silico completi con i migliori metodi computazionali. Con Discovery Studio Simulation, i ricercatori si concentrano sui candidati che hanno maggiori probabilità di successo negli studi clinici accelerando le tempistiche, riducendo i costi e snellendo il processo di scoperta delle bioterapie che, tradizionalmente, richiede molto lavoro.
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Domande frequenti sulle soluzioni bioterapeutiche
Le bioterapie, note anche come terapie biologiche, farmaci biologici o biofarmaci, derivano da organismi viventi. Si tratta di anticorpi monoclonali, terapie basate su anticorpi (ad esempio, coniugati anticorpo-farmaco, anticorpi bispecifici), vaccini, terapie cellulari e geniche e molto altro. Le bioterapie sono in genere più grandi e più complesse dei tradizionali farmaci a piccole molecole. Grazie alla loro maggiore specificità e alla capacità di bersagliare vie complesse, le bioterapie sono utilizzate per trattare molte malattie più complesse, come il cancro, i disturbi autoimmuni o le patologie neurologiche.
Discovery Studio Simulation è un'applicazione SaaS disponibile sulla piattaforma 3DEXPERIENCE che consente agli utenti di combinare il deep learning con la modellazione basata sulla fisica per la scoperta di farmaci in un'interfaccia intuitiva. Fornisce metodi per la previsione della struttura delle proteine, simulazioni di dinamica molecolare (MD), mappatura degli epitopi, umanizzazione e molto altro. Questa piattaforma completa supporta i ricercatori in tutte le fasi di scoperta e ottimizzazione delle bioterapie, riducendo i costi e accelerando le tempistiche.
Oltre all'algoritmo di modellazione omologica MODELER, affermatosi da tempo come leader del mercato, Discovery Studio Simulation offre il modello AlphaFold2, vincitore del premio Nobel per l'intelligenza artificiale, per la previsione della struttura dei multimeri. Dassault Systèmes è anche membro di OpenFold Consortium e offre OpenFold per la previsione della struttura dei monomeri. Gli utenti possono combinare questi modelli con simulazioni MD al fine di perfezionare le strutture generate dall'intelligenza artificiale e/o supportare i flussi di lavoro a valle, come il docking, il campionamento conformazionale e gli studi di formulazione delle proteine per ottimizzare i principali candidati.
Sì, in quanto applicazione SaaS, Discovery Studio Simulation elimina la necessità di hardware costoso o di competenze tecniche approfondite. La sua interfaccia basata sul cloud fornisce un accesso continuo all'High Performance Computing, consentendo ai ricercatori di eseguire operazioni complesse senza alcuno sforzo.
La piattaforma supporta un'ampia gamma di flussi di lavoro essenziali per la ricerca e lo sviluppo di processi bioterapeutici, tra cui:
- Previsione della struttura delle proteine
- Mappatura degli epitopi e maturazione dell'affinità
- Umanizzazione degli anticorpi
- Previsione della solubilità e formulazione degli eccipienti
- Docking e analisi dell'interazione tra proteine.
Integrando l'intelligenza artificiale e la modellazione basata sulla fisica, Discovery Studio Simulation ottimizza la scoperta di bioterapie. Aiuta i ricercatori a identificare i candidati migliori prima di passare ai test sperimentali. Di conseguenza, i team possono ridurre i tempi e i costi associati alla scoperta di bioterapie.
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