Visualisierung
Kostenlose, funktionsreiche Molekularvisualisierung
Visualisieren Sie Ihre Wissenschaft
Die molekulare Visualisierung ist ein wesentlicher Aspekt der Analyse und Kommunikation von Modellierungsstudien. Sie ermöglicht die Visualisierung eines mechanistischen Verständnisses der Struktur eines Moleküls, sodass wichtige Erkenntnisse zwischen Experten für Computermodellierung und Teammitgliedern ausgetauscht werden können.
BIOVIA Discovery Studio Visualisierung ist eine kostenlose, funktionsreiche molekulare Modellierungsanwendung zum Anzeigen, Teilen und Analysieren von Protein- und niedermolekularen Daten. Experten und ihre Kollegen können nahtlos und effizient Ergebnisse austauschen, ohne Zeit oder wissenschaftliche Informationen zu verlieren.
Discovery Studio Visualisierung wurde entwickelt, um die spezifischen Nuancen Ihrer Forschung darzustellen:
- Hochwertige Grafiken mit erweiterten Anzeigeoptionen und Stereounterstützung
- Möglichkeit, Bilder in Publikationsqualität zu generieren
- Interaktive grafische 3D-Ansicht mit zugeordneten Hierarchie- und Datentabellenansichten
- Mehrseitige Oberflächen und Isoflächen für eine verbesserte molekulare Visualisierung
- Möglichkeit zur Darstellung von Daten aus mehreren Datenreihen mit Linien- und Punktdarstellungen, 3D-Darstellungen und Balkendiagrammen
- Diagrammfunktionen einschließlich Wärmekarten, Histogrammen, Trefferraten-Plots und mehr
- Storyboard-Funktion zur Erfassung einer Reihe von molekularen Ansichten, die gezeigt und geteilt werden können
- Exportieren von Storyboards als Filme
- Sortierungs-, Filter- und Gruppierungsfunktionen, die für Eigenschaften in der Datentabelle verfügbar sind
- Perl-Scripting zur Automatisierung sich wiederholender Aufgaben oder zum Verknüpfen von Aufgaben für eine einfache Bedienung
- Die Werkzeugbedienfelder, Symbolleisten und das Layout der Benutzeroberfläche können nach Wunsch angepasst werden
- Unterstützung für eine Vielzahl von Struktur- und Sequenzdateiformaten
- RMS-Berechnungen sind in verschiedenen Detailebenen verfügbar
- Monitore sind für eine Vielzahl von günstigen, ungünstigen und unzufriedenen Non-Bond-Wechselwirkungen verfügbar
- Molecular Builder für Peptide und Nukleinsäuren
- Berechnung der Verfügbarkeit von Lösungsmitteln zur Ermittlung von verborgenen und freiliegenden Rückständen
- Grafische Funktionen, einschließlich Ramachandran und Kontaktdarstellungen
- Proteinstrukturen direkt aus der PDB-Datenbank laden
- Erstellung von Proteinberichten zur Zusammenfassung von Daten in Proteinstrukturen
- Biologisch aktive Einheit eines Proteins aus ihren Untereinheiten aufbauen
- Saubere Proteinfunktionalität, um fehlende Seitenketten hinzuzufügen, Störungen zu entfernen und die Atom-Benennung zu standardisieren
- Erweiterte Anzeige von Protein- und Nukleinsäuresequenzen und Analyse ihrer Zusammensetzung und Abgleiche
- Überlagern von Strukturen auf der Grundlage von Halteschnüren, Rückständen und Sequenzabgleich
- Sekundärstrukturvorhersage von Proteinsequenzen
- Anmerkungsfenster für die Anzeige und Bearbeitung von Beschriftungen für Nukleinsäuresequenzen und Proteinsequenzen
- Anzeigen und Konturieren von Dichtekarten der Röntgenelektronen
- Grundlegende Tools zum Bearbeiten von Röntgenstrukturen
- Stichprobennahme von Seitenketten-Rotameer-Konformationen und Analyse von Wechselwirkungen
- Rezeptor-Ligand-Interaktionsoberflächen zeigen Hydrophobizität, Wasserstoffbindung, Aromatizität und anderes
- Anzeige der 2D-Darstellung der Moleküle in der Datentabelle
- Skizzierwerkzeuge zur Erstellung neuer kleiner Moleküle
- Ändern oder Erstellen benutzerdefinierter kleiner 3D-Moleküle mithilfe eines Toolspanels und vordefinierten Fragmenten
- Optimieren der Geometrie von erstellten Strukturen mit einer Art schnellem Dreiding-Kraftfeld
- Grundlegende molekulare Eigenschaften können berechnet werden, z. B. Molekülformel und Molekulargewicht
- Überlagern von Strukturen auf der Grundlage von molekularen Überlagerungen mithilfe von Feldausrichtung oder Halteschnüren
- Definieren, Anzeigen und Bearbeiten von Liganden-Bindungsstellen
- Erzeugen Sie 2D-Rezeptor-Ligand-Interaktionsdiagramme
- Analysieren der Ligandenbindungsmuster zwischen einem Protein und seinen gebundenen Liganden
- Manuelle Generierung von Pharmakophor-(Katalysator)-Abfragen
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