STAGE - Ingénieur de recherche : Modélisation d’un microorganisme modèle pour une fermentation de précision (H/F)

Nous travaillons dans l’équipe Recherche sur des technologies pour la prochaine génération de produits et de services 3DS.

L'équipe Living Therapeutics travaille dans le cadre de ses activités sur la construction et l'utilisation de jumeaux virtuels pour la biofabrication de médicaments pour les soins de santé et d'ingrédients pour l'industrie alimentaire.

Notre objectif est de construire ces jumeaux pour aider à optimiser les protocoles de bioprocédés pendant le développement du processus et pour contrôler ces processus pendant la fabrication.

Nous attachons un intérêt particulier à la connexion entre les systèmes vivants (micro-organismes, cellules et même tissus) et les dispositifs de production (ex. bioréacteurs).

La fermentation de précision est un domaine qui utilise des micro-organismes pour produire des protéines alternatives et des ingrédients alimentaires afin de réduire l'empreinte énergétique et d'augmenter la durabilité.

Vos missions

Vous commencerez votre stage par une recherche bibliographique sur le réseau métabolique à l'échelle du génome d'un micro-organisme particulier utilisé dans la fermentation de précision.

Vous utiliserez ensuite ce réseau pour construire un modèle métabolique à l'échelle du génome et l'intégrerez dans notre bioréacteur jumelé existant.

Dans une dernière étape, vous analyserez et appliquerez ce modèle aux questions d'optimisation des processus de bioproduction.

Ramos, J. R. C., Oliveira, G. P., Dumas, P. & Oliveira, R. Genome-scale modeling of Chinese hamster ovary cells by hybrid semi-parametric flux balance analysis. Bioprocess Biosyst Eng 45, 1889-1904 (2022).

Ferreira, A. R. et al. Fast development of Pichia pastoris GS115 Mut+ cultures employing batch-to-batch control and hybrid semi-parametric modeling. Bioprocess Biosyst Eng 37, 629-639 (2014).