Collections Chemistry
Une suite complète d'applications pour la recherche en chimie
Favoriser les innovations axées sur la chimie
Les structures chimiques contiennent une mine d'informations précieuses, mais leur obtention reste un défi.
Les collections BIOVIA Pipeline Pilot Chemistry offrent une suite complète de filtres, de manipulateurs et de calculateurs de propriétés moléculaires. Cette collection de composants modulaires étend les capacités standard de BIOVIA Pipeline Pilot pour inclure le traitement des composés et les analyses de chimio-informatique. Grâce à ces améliorations, les utilisateurs peuvent créer des protocoles pour un large éventail d'applications chimiques.
Avantages de la collection
- Collection Chemistry
- Collection ADMET
Accédez à des solutions, traitez-les, modélisez-les et déployez-les afin d'extraire des informations exploitables à partir de vos données chimiques. Fonctionnalités clés de la collection :
- Choisissez votre façon de lire et d'écrire les données chimiques. La collection prend en charge les formats BIOVIA MOL, SD, SDF, RG, SKC, XD, XDF, RXN, RD, RDF (formats BIOVIA via MDL), d'autres formats tels que UDM, HELM 1 et 2, XHELM (Pistoia) ou MOL2 (de Tripos), CDX, CDXML (de
Perkin-Elmer) et les formats publics tels que PDB. - Visualisez les données structurelles et moléculaires dans le logiciel de votre choix. La collection intègre plusieurs visualiseurs de structures populaires, notamment BIOVIA Discovery Studio Visualizer et BIOVIA Insight for Excel.
- Mettez à profit la science des données et le machine learning dans le domaine de la chimie. Les empreintes moléculaires ECFP (Extended Connectivity Fingerprints) permettent d'identifier les principaux motifs structuraux dans les applications de recherche, de groupement (clustering) et de modélisation.
- Filtrez et manipulez les données d'après les propriétés chimiques. Préparez les données à analyser à l'aide de filtres de sous-structures, de Lipinski ou personnalisés.
- Automatisez les calculs et les workflows. Calculez en quelques secondes des propriétés de type AlogP, pKa, solubilité, masse moléculaire, indices électrotopologiques et surface accessible aux solvants pour des milliers de molécules.
- Utilisez des outils d'analyse prêts à l'emploi : méthode MMPA (Matched Molecular Pair Analysis), classification hiérarchique des échafaudages moléculaires, estimation quantitative de la ressemblance médicamenteuse, accessibilité synthétique, etc.
Il est essentiel d'optimiser les propriétés ADMET (absorption, distribution, métabolisme, excrétion et toxicité) des candidats thérapeutiques pour favoriser leur développement. La collection ADMET permet de modéliser diverses activités biologiques telles que l'absorption intestinale chez l'homme, la fixation des médicaments aux protéines plasmatiques et l'hépatotoxicité.
- Profilage rapide des collections de composés pour les distributions de propriétés ADMET
- Élimination des composés présentant des caractéristiques ADMET défavorables
- Proposition d'améliorations des composés pour optimiser leurs propriétés ADMET
- Fusion des propriétés ADMET avec d'autres données dans les rapports
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