STAGE - Ingénieur de recherche : NLP pour l’analyse de recommandations médicales (H/F)

France, 78, Vélizy-Villacoublay
Stage
9/3/2024
540084

Au sein du département Recherche de Dassault Systèmes, vous intégrerez l’équipe de recherche Oncology Twin qui vise à projeter les technologies de traitement de données (imagerie, génomique, textuelles, etc…) dans la pratique médicale de demain. Dans le cadre d'un programme de recherche collaboratif, vous aurez l'opportunité de développer des technologies innovantes au service des médecins qui s'intégreront dans une solution médicale future pour améliorer le diagnostic et offrir un soin personnalisé à chaque patient atteint de cancer.

Le stage fera partie d’un groupe de travail dédié à la modélisation des guidelines (recommandations thérapeutiques) constitués d’experts à la fois et en recherche et en développement de logiciel, mais aussi d’autres stagiaires. Le stage s’intègrera dans un projet de grande ampleur, MEDITWIN : https://www.3ds.com/fr/newsroom/press-releases/meditwin-launch.

Vos missions

Lors de la prise en charge d’un patient atteint de cancer, les praticiens utilisent des recommandations médicales (en anglais : guidelines) qui permettent de standardiser les soins. Ces recommandations se basent sur la connaissance scientifique actuelle mais aussi l’expérience pratique. Elles sont rédigées par des praticiens, notamment via des publications scientifiques.

L’objectif de ce stage sera d’analyser ces recommandations afin de construire un arbre de décision regroupant l’ensemble de la connaissance des recommandations de traitements. Il faudra pour cela identifier les traitements recommandés pour les différents profils de patients dans ces documents. Des technologies de NLP devront être mises en place pour détecter les entités (caractéristiques du patient, traitements…) mais aussi désambiguïser les données, en utilisant notamment des ontologies. La pertinence de l’utilisation de LLM pourra être explorée. Ce stage se déroulera en collaboration étroite avec un autre stagiaire qui travaillera plus particulièrement sur les ontologies et le data model.

Vous aurez pour mission de :

  • Faire un état de l'art des méthodes de NLP permettant d’extraire les informations pertinentes des guidelines
  • Implémenter les méthodes identifiées
  • Evaluer les modèles produits
  • Communiquer les résultats obtenus, notamment via des présentations au reste de l’équipe

Vos qualifications

Etudiant(e) en école d’ingénieur ou université préparant un BAC+5, vous recherchez un stage.

Compétences techniques souhaitées :

  • Bonnes connaissances en Deep Learning et notamment en NLP/LLM
  • Bonnes connaissances en programmation et en particulier du langage python
  • Connaissances en Pytorch ou Tensorflow
  • Capacité à lire et rechercher de la littérature scientifique
  • Des connaissances en biologie / médecine serait un plus
  • Compétences en ontologie serait un plus
  • Maitrise de l'anglais

 

Soft skills

  • Etre capable de travailler dans un environnement pluridisciplinaire
  • Curiosité
  • Autonomie
  • Savoir communiquer
  • Savoir travailler en équipe

 

Nous rejoindre c'est aussi

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  • Environnement collaboratif et innovant
  • Collaboration internationale
  • Diversité des technologies, produits et solutions
  • Engagement en faveur de la diversité et de l’inclusion

Déclaration de diversité

Dassault Systèmes, avant-gardiste en matière de technologie et d’innovation durable, s’efforce de créer des équipes toujours plus inclusives et diverses à travers le monde. Nous avons la forte conviction que nos employés sont notre atout numéro 1 et nous voulons que tous, se sentent libres d’être pleinement qui ils sont vraiment. Notre objectif est qu’ils ressentent fierté et sentiment d’appartenance. En tant qu’entreprise à la pointe du changement, il nous incombe de favoriser l’inclusion de tous et participer à création du monde de demain.
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